Doanh nghiệp doanh thu dưới 100 triệu/năm có phải kê khai thuế GTGT không?

Doanh thu thấp không đồng nghĩa với miễn kê khai. Với doanh nghiệp, cơ quan thuế kiểm tra rất kỹ sự khác biệt giữa “không phát sinh thuế phải nộp” và “không cần nộp tờ khai”. Đây là lỗi phổ biến mà nhiều doanh nghiệp mắc phải.

I. Bảng tra cứu nhanh

II. Vì sao doanh nghiệp vẫn phải kê khai khi doanh thu thấp?

1. Bản chất của nghĩa vụ kê khai

Nghĩa vụ kê khai và số thuế phải nộp là hai vấn đề khác nhau. Nhiều doanh nghiệp có doanh thu thấp hiểu nhầm là không cần nộp tờ khai, nhưng đây là cách hiểu sai.

• Doanh nghiệp thuộc diện kê khai thuế GTGT phải nộp hồ sơ theo đúng kỳ khai.
• Nếu số thuế GTGT phải nộp là 0, điều đó chỉ biểu thị kết quả tính thuế, không miễn nghĩa vụ kê khai.
• Ngay cả khi không phát sinh doanh thu, doanh nghiệp vẫn phải nộp tờ khai, trừ trường hợp tạm ngừng kinh doanh theo quy định.

2. Nhầm lẫn phổ biến với hộ kinh doanh, cá nhân kinh doanh

Doanh nghiệp thường nhầm lẫn khi áp dụng ngưỡng doanh thu miễn thuế của hộ, cá nhân kinh doanh vào mình, điều này không chính xác.

• Ngưỡng miễn thuế 1 tỷ đồng/năm trở xuống dành cho hộ, cá nhân sản xuất, kinh doanh có hiệu lực từ 01/01/2026.
• Doanh nghiệp không được áp dụng ngưỡng miễn thuế này để được miễn kê khai thuế GTGT.

Ví dụ thực tế

Một công ty mới hoạt động với doanh thu cả năm vài chục triệu đồng, nếu vẫn thuộc diện kê khai thuế GTGT, hồ sơ khai thuế phải nộp đúng kỳ. Thanh tra thường hỏi việc không nộp tờ khai trong những kỳ không phát sinh doanh thu.

III. Kỳ khai, mẫu tờ khai và thời hạn nộp

1. Kỳ khai thuế GTGT

• Khai tháng nếu tổng doanh thu năm trước trên 50 tỷ đồng.
• Khai quý nếu tổng doanh thu năm trước từ 50 tỷ đồng trở xuống.
• Doanh nghiệp mới thành lập khai theo quý; sau 12 tháng hoạt động mới xác định kỳ khai theo doanh thu.

2. Hồ sơ và mẫu tờ khai

Doanh nghiệp áp dụng phương pháp khấu trừ sử dụng Tờ khai thuế GTGT mẫu số 01/GTGT. Hồ sơ gồm tờ khai và các phụ lục liên quan nếu có. Doanh nghiệp thường sai sót khi nộp thiếu phụ lục hoặc bỏ qua kỳ không phát sinh hoạt động.

3. Thời hạn nộp tờ khai

Mẹo kiểm tra nhanh: Trước hạn nộp, rà soát lại kỳ khai, mẫu tờ khai đang dùng và tình trạng tạm ngừng kinh doanh (nếu có). Hồ sơ chậm thường do nhầm lẫn kỳ khai tháng và quý.

IV. Xử phạt khi chậm nộp tờ khai

Doanh thu thấp không giảm thiểu rủi ro vi phạm thủ tục khai thuế. Việc bỏ sót tờ khai nhiều kỳ dễ dẫn đến xử phạt hành chính.

• Phạt cảnh cáo khi chậm nộp từ 1 đến 5 ngày và có tình tiết giảm nhẹ.
• Phạt tiền từ 2 đến 5 triệu đồng khi nộp hồ sơ chậm từ 1 đến 30 ngày.
• Phạt tiền từ 5 đến 8 triệu đồng khi nộp hồ sơ chậm từ 31 đến 60 ngày.
• Phạt nghiêm trọng hơn với vi phạm kéo dài hoặc tái phạm.

Lưu ý quan trọng

Nếu doanh nghiệp tạm ngừng kinh doanh hợp lệ, cần kiểm tra chính xác thời gian tạm ngừng để biết có phải nộp hồ sơ khai thuế hay không. Việc tạm ngừng không đúng thủ tục vẫn bị xem là có nghĩa vụ kê khai. Nên rà soát đồng thời đăng ký thuế, tình trạng hoạt động và kỳ khai để tránh sót tờ khai.