Nếu doanh nghiệp thanh toán hóa đơn trên 5 triệu đồng bằng hình thức chuyển khoản nhưng chuyển nhầm số tiền hoặc chuyển thiếu tiền, phần còn lại thanh toán sau, hóa đơn có được khấu trừ thuế GTGT không?

I. Điều kiện khấu trừ thuế GTGT cho hóa đơn từ 5 triệu đồng

• Hóa đơn có giá trị từ 5 triệu đồng trở lên (áp dụng từ 01/07/2025) phải được thanh toán toàn bộ bằng hình thức không dùng tiền mặt (chuyển khoản).
• Mỗi lần thanh toán phải có chứng từ hợp lệ (ủy nhiệm chi, giấy báo nợ) ghi rõ số hóa đơn tương ứng.
• Phần giá trị chưa thanh toán hoặc thanh toán sai hình thức sẽ không đủ điều kiện khấu trừ cho đến khi được bổ sung đúng quy định.

II. Xử lý các trường hợp chuyển thiếu hoặc chuyển nhầm tiền

Sai sót trong quá trình thanh toán không phải là sai sót nội dung hóa đơn, do đó doanh nghiệp không cần lập hóa đơn điều chỉnh mà chỉ cần hoàn thiện chứng từ thanh toán.

III. Thời điểm được khấu trừ thuế

• Thuế GTGT được khấu trừ tại kỳ kê khai mà doanh nghiệp đáp ứng đủ điều kiện về thanh toán và có chứng từ hợp lệ.
• Nếu thanh toán làm nhiều lần, phần thuế tương ứng với số tiền đã thanh toán ở kỳ nào sẽ được khấu trừ ở kỳ đó.

Ví dụ thực tế

• Hóa đơn GTGT trị giá 10 triệu đồng, phát sinh trong kỳ kê khai Quý 4.
  • Lần 1 (trong Quý 4): Doanh nghiệp chuyển khoản 7 triệu đồng. → Được khấu trừ thuế GTGT tương ứng với 7 triệu đồng trong kỳ Quý 4.
  • Lần 2 (trong Quý 1 năm sau): Doanh nghiệp chuyển khoản bổ sung 3 triệu đồng còn lại. → Được khấu trừ nốt phần thuế GTGT tương ứng với 3 triệu đồng trong kỳ Quý 1 năm sau.

Lưu ý quan trọng

• Chứng từ thanh toán: Mỗi lần chuyển khoản phải có chứng từ hợp lệ ghi rõ số hóa đơn, giá trị từng lần chuyển để chứng minh với cơ quan thuế.
• Lỗi thanh toán và lỗi hóa đơn: Cần phân biệt rõ, việc chuyển tiền sai không phải là sai sót trên hóa đơn, do đó không cần xuất hóa đơn điều chỉnh nếu nội dung hóa đơn đã đúng.
• Kê khai bổ sung: Doanh nghiệp có thể thực hiện kê khai bổ sung cho các kỳ trước nếu phát hiện sai sót trước khi cơ quan thuế có quyết định thanh tra, kiểm tra.
• Thời hạn lưu chứng từ: Toàn bộ chứng từ thanh toán phải được lưu giữ tối thiểu 10 năm theo quy định của Luật Quản lý thuế.